為提高獸醫臨床教學水平和滿足社會服務需要，畜牧獸醫系成立浙江大學獸醫院，吳蘭生教授認第一任院長。自此，獸醫人才培養開啟了新局面，畜牧獸醫面向社會服務的序章拉開。醫院位于杭州市凱旋路，面積不足50平方米，坐診醫生6人均為畜牧獸醫系教師。
1963
在動蕩的歲月里，獸醫系遷至臨安天目林學院。獸醫院因一直以來在農業生產、畜牧診療中發揮的重要作用得以保留。在艱難的環境下堅持開展對養殖場、畜牧場等經濟動物疾病診治工作，為動物醫學的發展積累了寶貴的臨床經驗。期間偶有家養小動物問診。
1969-1970
畜牧獸醫系遷回杭州華家池校本部，獸醫院的醫師力量得到了及時的補充。同時在臨床教學上開始更廣闊領域的摸索和實踐。
1973
畜牧獸醫系教師發明的“家畜電針麻醉”獲得全國科學大會優秀科技成果獎。其臨床經驗的積累，大部分在獸醫院完成。
1978
開始招收“中獸醫”碩士研究生，學科負責人蔣次升教授開展中西獸醫結合防治動物疾病方面的研究。獸醫院擔負起重要的臨床教學、科學研究的工作。
1982
臺灣愛國學者盧守耕教授捐款十萬美元，選址華家池東北部，艮山西路沿線新建動物醫院。
1992
畜牧獸醫系撤系建院，成立浙江農業大學動物科學學院，獸醫院也納入其中，依然擔負臨床教學和社會服務的工作。此時的獸醫院就診的動物中已有近5成的家養寵物。
1993
浙江大學、杭州大學、浙江農業大學、浙江醫科大學四校合并成立新浙江大學。獸醫院重回浙大懷抱，更名為浙江大學附屬動物醫院，院址艮山西路91號。
1998
8月學院啟動整體從華家池校區搬遷至紫金港校區工作。
2010
12月浙江大學附屬動物醫院遷至萍水西街235號，占地面積700平方米，上下兩層。此時就診動物已經發生了巨大的變化，近9成為家養寵物。同時，大量的流浪動物被送醫院，接受專業治療。
2011
